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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Suínos e Aves. Para informações adicionais entre em contato com cnpsa.biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
04/10/2019 |
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Data da última atualização: |
04/10/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
MOREIRA, G. C. M.; SALVIAN, M.; BOSCHIERO, C.; CESAR, A. S. M.; REECY, J. M.; GODOY, T. F.; LEDUR, M. C.; GARRICK, D.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO, L. L. |
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Afiliação: |
GABRIEL COSTA MONTEIRO MOREIRA, ESALQ; MAYARA SALVIAN, ESALQ; CLARISSA BOSCHIERO, ESALQ; ALINE SILVA MELLO CESAR, ESALQ; JAMES M. REECY, Iowa State University/Department of Animal Science; THAIS FERNANDA GODOY, ESALQ; MONICA CORREA LEDUR, CNPSA; DORIAN J. GARRICK, Massey University/ School of Agriculture; GERSON BARRETO MOURÃO, ESALQ; LUIZ LEHMMAN COUTINHO, ESALQ. |
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Título: |
Genome-wide association scan for QTL and their positional candidate genes associated with internal organ traits in chickens. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
BMC Genomics, v. 20, n. 669, 2019. |
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DOI: |
10.1186/s12864-019-6040-3 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract Background: Poultry breeding programs have been focused on improvement of growth and carcass traits, however, this has resulted in correlated changes in internal organ weights and increased incidence of metabolic disorders. These disorders can affect feed efficiency or even cause death. We used a high density SNP array (600 K, Affymetrix) to estimate genomic heritability, perform genome-wide association analysis, and identify genomic regions and positional candidate genes (PCGs) associated with internal organ traits in an F2 chicken population. We integrated knowledge of haplotype blocks, selection signature regions and sequencing data to refine the list of PCGs. Results: Estimated genomic heritability for internal organ traits in chickens ranged from low (LUNGWT, 0.06) to high (GIZZWT, 0.45). A total of 20 unique 1 Mb windows identified on GGA1, 2, 4, 7, 12, 15, 18, 19, 21, 27 and 28 were significantly associated with intestine length, and weights or percentages of liver, gizzard or lungs. Within these windows, 14 PCGs were identified based on their biological functions: TNFSF11, GTF2F2, SPERT, KCTD4, HTR2A, RB1, PCDH7, LCORL, LDB2, NR4A2, GPD2, PTPN11, ITGB4 and SLC6A4. From those genes, two were located within haplotype blocks and three overlapped with selection signature regions. A total of 13,748 annotated sequence SNPs were in the 14 PCGs, including 156 SNPs in coding regions (124 synonymous, 26 non-synonymous, and 6 splice variants). Seven deleterious SNPs were identified in TNFSF11, NR4A2 or ITGB4 genes. Conclusions: The results from this study provide novel insights to understand the genetic architecture of internal organ traits in chickens. The QTL detection performed using a high density SNP array covered the whole genome allowing the discovery of novel QTL associated with organ traits. We identified PCGs within the QTL involved in biological processes that may regulate internal organ growth and development. Potential functional genetic variations were identified generating crucial information that, after validation, might be used in poultry breeding programs to reduce the occurrence of metabolic disorders. MenosAbstract Background: Poultry breeding programs have been focused on improvement of growth and carcass traits, however, this has resulted in correlated changes in internal organ weights and increased incidence of metabolic disorders. These disorders can affect feed efficiency or even cause death. We used a high density SNP array (600 K, Affymetrix) to estimate genomic heritability, perform genome-wide association analysis, and identify genomic regions and positional candidate genes (PCGs) associated with internal organ traits in an F2 chicken population. We integrated knowledge of haplotype blocks, selection signature regions and sequencing data to refine the list of PCGs. Results: Estimated genomic heritability for internal organ traits in chickens ranged from low (LUNGWT, 0.06) to high (GIZZWT, 0.45). A total of 20 unique 1 Mb windows identified on GGA1, 2, 4, 7, 12, 15, 18, 19, 21, 27 and 28 were significantly associated with intestine length, and weights or percentages of liver, gizzard or lungs. Within these windows, 14 PCGs were identified based on their biological functions: TNFSF11, GTF2F2, SPERT, KCTD4, HTR2A, RB1, PCDH7, LCORL, LDB2, NR4A2, GPD2, PTPN11, ITGB4 and SLC6A4. From those genes, two were located within haplotype blocks and three overlapped with selection signature regions. A total of 13,748 annotated sequence SNPs were in the 14 PCGs, including 156 SNPs in coding regions (124 synonymous, 26 non-synonymous, and 6 splice variants). Seven deleterious SNPs we... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Deleterious mutations; Genomic heritability; GWAS; Metabolic disorders. |
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Thesagro: |
Avicultura; Genética Animal; Genoma; Melhoramento Genético Animal. |
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Thesaurus Nal: |
Genomics; Gizzard; Heart; Intestines; Liver; Lungs; Metabolic diseases. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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Biblioteca |
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Tipo/Formato |
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Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agropecuária Oeste. |
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Data corrente: |
18/10/1999 |
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Data da última atualização: |
20/01/2014 |
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Autoria: |
MELHORANCA, A. L. |
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Título: |
Seletividade dos herbicidas diclosulam, flumetsulam e cloransulam em diversas cultivares de soja. |
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Ano de publicação: |
1999 |
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Fonte/Imprenta: |
In: REUNIÃO DE PESQUISADORES EM CONTROLE DE PLANTAS DANINHAS NOS CERRADOS, 12., 1999, Corumbá. Controle químico de plantas daninhas nos cerrados: ata e anais. |
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Páginas: |
p. 15-18. |
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Série: |
(Embrapa Agropecuária Oeste. Documentos, 3). |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
A seletividade eh a capacidade que um herbicida tem de controlar as plantas daninhas que se encontram em uma cultura sem reduzir a produtividade e a qualidade do produto final. Este trabalho teve como objetivo avaliar a seletividade dos herbicidas diclosulam (Spider), flumetsulam (Scorpion) e cloransulam (Pacto) nas cultivares de soja BR-16, BR-9112410, Embrapa 64 (Ponta Pora), BR-37, BR-9113306, Lambari, Cambara, Embrapa-61, Conquista e Embrapa 65 (Itapoty). O experimento foi conduzido na area experimental da Embrapa Agropecuaria Oeste, municipio de Dourados, MS, durante a safra de 1998/99. O ensaio foi delineado em blocos ao acaso com parcelas subdivididas, com quatro repeticoes. As parcelas foram os herbicidas e as subparcelas, as cultivares. Realizaram-se avaliacoes de fitotoxicidade aos 14, 21 e 30 dias apos a aplicacao dos tratamento empregando-se o metodo de avaliacao visual atraves de uma escala de 0 a 100, onde: 0= nenhuma injuria na planta e 100=morte total da planta. Avaliou-se a altura de planta, o numero de plantas por metro e a producao de graos. A analise dos resultados permitiu concluir que o herbicida diclosulam na dose de 35 g i.a/ha e as misturas de diclosulam + flumetsulam nas doses de 20 + 94 g .i.a./ha, cloransulam + lactofen nas doses de 40 + 120 g i.a./ha e cloransulam + imazethapyr nas doses de 30 + 50 g i.a./ha nao afetaram a altura, o numero de plantas por metro linear e o rendimento de graos, mostrando serem altamente seletivos para as cultivares de soja BR-16, BR-9112410, Embrapa 64 (Ponta Pora), BR-37, BR-9113306, Lambari, Cambara, Embrapa-61, Conquista e Embrapa 65 (Itapoty). MenosA seletividade eh a capacidade que um herbicida tem de controlar as plantas daninhas que se encontram em uma cultura sem reduzir a produtividade e a qualidade do produto final. Este trabalho teve como objetivo avaliar a seletividade dos herbicidas diclosulam (Spider), flumetsulam (Scorpion) e cloransulam (Pacto) nas cultivares de soja BR-16, BR-9112410, Embrapa 64 (Ponta Pora), BR-37, BR-9113306, Lambari, Cambara, Embrapa-61, Conquista e Embrapa 65 (Itapoty). O experimento foi conduzido na area experimental da Embrapa Agropecuaria Oeste, municipio de Dourados, MS, durante a safra de 1998/99. O ensaio foi delineado em blocos ao acaso com parcelas subdivididas, com quatro repeticoes. As parcelas foram os herbicidas e as subparcelas, as cultivares. Realizaram-se avaliacoes de fitotoxicidade aos 14, 21 e 30 dias apos a aplicacao dos tratamento empregando-se o metodo de avaliacao visual atraves de uma escala de 0 a 100, onde: 0= nenhuma injuria na planta e 100=morte total da planta. Avaliou-se a altura de planta, o numero de plantas por metro e a producao de graos. A analise dos resultados permitiu concluir que o herbicida diclosulam na dose de 35 g i.a/ha e as misturas de diclosulam + flumetsulam nas doses de 20 + 94 g .i.a./ha, cloransulam + lactofen nas doses de 40 + 120 g i.a./ha e cloransulam + imazethapyr nas doses de 30 + 50 g i.a./ha nao afetaram a altura, o numero de plantas por metro linear e o rendimento de graos, mostrando serem altamente seletivos para as cultivares ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Congresses; Congresso; Planta daninha; Seletividade. |
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Thesagro: |
Cerrado; Glycine Max; Herbicida; Soja. |
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Thesaurus NAL: |
chemical control; cloransulam; diclosulam; flumetsulam; herbicides; soybeans; weeds. |
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Categoria do assunto: |
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Marc: |
LEADER 02609naa a2200325 a 4500
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005 2014-01-20
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100 1 $aMELHORANCA, A. L.
245 $aSeletividade dos herbicidas diclosulam, flumetsulam e cloransulam em diversas cultivares de soja.
260 $c1999
300 $ap. 15-18.
490 $a(Embrapa Agropecuária Oeste. Documentos, 3).
520 $aA seletividade eh a capacidade que um herbicida tem de controlar as plantas daninhas que se encontram em uma cultura sem reduzir a produtividade e a qualidade do produto final. Este trabalho teve como objetivo avaliar a seletividade dos herbicidas diclosulam (Spider), flumetsulam (Scorpion) e cloransulam (Pacto) nas cultivares de soja BR-16, BR-9112410, Embrapa 64 (Ponta Pora), BR-37, BR-9113306, Lambari, Cambara, Embrapa-61, Conquista e Embrapa 65 (Itapoty). O experimento foi conduzido na area experimental da Embrapa Agropecuaria Oeste, municipio de Dourados, MS, durante a safra de 1998/99. O ensaio foi delineado em blocos ao acaso com parcelas subdivididas, com quatro repeticoes. As parcelas foram os herbicidas e as subparcelas, as cultivares. Realizaram-se avaliacoes de fitotoxicidade aos 14, 21 e 30 dias apos a aplicacao dos tratamento empregando-se o metodo de avaliacao visual atraves de uma escala de 0 a 100, onde: 0= nenhuma injuria na planta e 100=morte total da planta. Avaliou-se a altura de planta, o numero de plantas por metro e a producao de graos. A analise dos resultados permitiu concluir que o herbicida diclosulam na dose de 35 g i.a/ha e as misturas de diclosulam + flumetsulam nas doses de 20 + 94 g .i.a./ha, cloransulam + lactofen nas doses de 40 + 120 g i.a./ha e cloransulam + imazethapyr nas doses de 30 + 50 g i.a./ha nao afetaram a altura, o numero de plantas por metro linear e o rendimento de graos, mostrando serem altamente seletivos para as cultivares de soja BR-16, BR-9112410, Embrapa 64 (Ponta Pora), BR-37, BR-9113306, Lambari, Cambara, Embrapa-61, Conquista e Embrapa 65 (Itapoty).
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650 $adiclosulam
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653 $aCongresso
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653 $aSeletividade
773 $tIn: REUNIÃO DE PESQUISADORES EM CONTROLE DE PLANTAS DANINHAS NOS CERRADOS, 12., 1999, Corumbá. Controle químico de plantas daninhas nos cerrados: ata e anais.
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Esconder MarcMostrar Marc Completo |
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Registro original: |
Embrapa Agropecuária Oeste (CPAO) |
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